Die MSB bündelt ihre Forschungsaktivitäten in Forschungsinstituten. Diese ermöglichen eine Vernetzung der Wissenschaftler:innen, um gemeinsame Forschungsfragen zu entwickeln, Ressourcen zu bündeln und die Zusammenarbeit durch gemeinsame Forschungsprojekte und Publikationen sichtbar zu machen. Zudem ermöglichen die Forschungsinstitute die nötige Infrastruktur für Anschubfinanzierungen erster Projektideen, der Organisation von wissenschaftlichen Konferenzen und bspw. Summer Schools sowie technische Plattformen, welche als wissenschaftliche Dienstleistungen allen Forscher:innen der MSB und des Hochschulverbundes zugänglich sind.
Die Forschungsinstitute fördern die Repräsentation der Wissenschaftler:innen auf nationalen und internationalen Kongressen sowie in Konsortien und Fachgesellschaften. Die Forschungsprojekte innerhalb der Forschungsinstitute werden unter Beteiligung nationaler und internationaler Institutionen von nationalen und internationalen Förderern bzw. Fördergemeinschaften finanziert.
